Đặc điểm phân tử GENE ORF1a của AVIAN NEPHRITIS Virus gây bệnh viêm thận trên Gà

Abstract

Nghiên cứu đặc điểm phân tử gene ORF1a của avian nephritis virus gây bệnh viêm thận trên gà được thực hiện nhằm xác định đặc điểm phân tử và kiểu gene ANV dựa vào phân tích trình tự nucleotide và amino acid của ORF1a. Kiểm tra 96 mẫu mô (khí quản, thận và ruột) từ gà có triệu chứng ủ rũ, bỏ ăn, còi cọc và chết (ở gà con) bằng kỹ thuật realtime RT-PCR đã phát hiện 47 mẫu dương tính với ANV, chiếm tỷ lệ 48,95%. Kết quả phân tích di truyền phả hệ, mức độ tương đồng trình tự nucleotide gene ORF1a của 2 chủng đã phát hiện được: ANV-ORF1a-MK1 (PP942994) và ANV-ORF1a-MK2 (PP942995) thuộc chung nhóm và có tỷ lệ tương đồng cao với các chủng thuộc kiểu gene 8 với tỷ lệ tương đồng từ 93,27% - 98,95%. Kết quả so sánh trình tự amino acid hai chủng ANV-ORF1a-MK1 và ANV-ORF1a-MK2 với các chủng tham chiếu cho thấy 2 chủng lưu hành này có tỷ lệ tương đồng cao với các chủng tham chiếu kiểu gene 8 (95,45% - 96,79%); và đột biến thay thế amino acid chủ yếu xảy ra ở vị trí 91 – 123. Từ các kết quả trên cho thấy hai chủng ANV-ORF1a-MK1 và ANV-ORF1a-MK2 thuộc kiểu gene 8.