Xây dựng mô hình dự đoán hoạt tính ức chế enzym p38 của các dẫn chất 1,2,4-triazin

Abstract

Mô hình 2D-QSAR được xây dựng dựa trên thuật toán bình phương tối thiểu từng phần PLS (phần mềm MOE) trên cơ sở dữ liệu gồm 5 tập dẫn chất pyrrolo [2,1- f] [1,2,4] triazin, pyridopyridazin-6-on, phenoxypyrimiden, quinazolinon, chromon (187 chất) có giá trị IC50. Mặt khác, công cụ FlexX tích hợp trong LeadIT được sử dụng để nghiên cứu mô hình mô tả phân tử docking của năm tập chất này. Mô hình 2D-QSAR và docking sau khi xây dựng được ứng dụng để sàng lọc 20 chất có chung cấu trúc 1,2,4-triazin để tìm ra những chất có tiềm năng ức chế tốt enzym p38. Nghiên cứu xây dựng được mô hình 2D-QSAR với giá trị R2 là 0,73, giá trị RMSE là 0,41. Mặt khác, phân tích kết quả docking cho thấy các acid amin đóng vai trò quan trọng trong việc gắn kết với ligand bao gồm Met 109, Asp 168 và Glu 71. Kết quả ứng dụng mô hình 2D-QSAR và docking trên 20 chất cho thấy nhiều hợp chất 1,2,4-triazin được dự đoán có khả năng gắn kết tốt với p38.